"無組織核的單細胞微生物",有時會引起疾病,1847年,現代拉丁語 bacterium 的複數形式,源自希臘語 bakterion "小棒",是 baktron "棒,杆,棍"的小型形式。因爲最早觀察到的是棒狀的,所以被稱爲細菌。德國博物學家克里斯蒂安·戈特弗裏德·埃倫貝格於1838年引入了這個科學詞彙。有時也會錯誤地使用經典複數形式作爲單數。
希臘詞源於原始印歐語 *bak- "用於支撐的杆,釘"(比較拉丁語 baculum "杆,手杖"; 愛爾蘭語 bacc,威爾士語 bach "鉤,彎曲的杆"; 中古荷蘭語 pegel "釘,銷,螺栓")。德·範寫道:"由於原始印歐語中很少有*b,而凱爾特語顯示出無法解釋的雙子音,我們可能正在處理一個來自未知來源的藉詞。"