12世紀後半、sinagogという言葉が登場しました。これは「ユダヤ人の定期的な公の礼拝と宗教教育」を指し、またヘブライ語の礼拝を行う場所や建物を意味しました。この言葉は古フランス語のsinagoge（「シナゴーグ、モスク、異教の神殿」を意味する、11世紀のもの。現代フランス語ではsynagogue）から来ており、さらに遅いラテン語のsynagoga（「ユダヤ人の集まり」を意味する）を経て、ギリシャ語のsynagōgē（「集まる場所；会合、集会」を意味する）に遡ります。このギリシャ語の言葉は、七十人訳聖書や新約聖書で「シナゴーグ」を指すために使われました。語源的には「集めること」を意味し、synagein（「集める、まとめる、集会を開く」）から派生しています。これはsyn-（「共に」、syn-を参照）と、agein（「動かす、動かすことをする」、PIE語根*ag-「駆り立てる、引き出す、動かす」から）を組み合わせたものです。
この言葉は、ギリシャ語の旧約聖書版では、後期ヘブライ語のkeneseth（「集まり」、具体的にはbeth keneseth「シナゴーグ」、直訳すると「集まりの家」）の借用翻訳として使われました。これはKnesset（イスラエルの国会の名称）と比較できます。関連語としては、Synagogical（シナゴーグに関する）、synagogal（シナゴーグの）が挙げられます。
